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磺酸基-Cy5-乙基 琥珀酰亚胺酯(远红外)Sulfo-Cy5-E SE (FIR)

目录号: PR01393 纯度: N/A
磺酸基-Cy5-乙基 琥珀酰亚胺酯(Sulfo-Cy5-E NHS Ester)是一种基于Cy5远红外荧光染料骨架改性的生物标记试剂。其分子结构在共轭的吲哚(Indole)环上引入了强吸电子的磺酸基(Sulfo-)‍,显著提升了水溶性,克服了传统Cy5在水相中的疏水性聚集问题。
磺酸基-Cy5-乙基 琥珀酰亚胺酯(远红外)(CAS 146368-14-1)产品图
CAS No. :146368-14-1
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中文名称
磺酸基-Cy5-乙基 琥珀酰亚胺酯(远红外)
中文别名
CY5-NHS酯;CY5活化酯;修饰Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯;Sulfo-Cyanine5 NHS ester,磺酸基-Cy5-N-羟基琥珀酰亚胺酯;磺基-CY5-N-羟基琥珀酰胺酯;Cy5-N-羟基琥珀酰亚胺酯
英文名称
Sulfo-Cy5-E SE (FIR)
英文别名
3H-Indolium,2-[5-[1-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1-ethyl-3,3-dimethyl-5-sulfo-,inner salt;3H-Indolium,2-[5-[1-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3-p;Cy5 NHS Ester;Cy5-SE;Cy5-succinimidyl ester;3H-Indolium,2-[5-[1-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadienyl]-1-ethyl-3,3-dimethyl-5-sulfo-,inner salt;Cy 5.29OSu;Cy5;Fluorolink Cy5;FluoroLink Mono Reactive DyeCy5;CY 5-NHS;Cyanine 5;CY6-SE;Sulfo-Cy5-SE;Cyanine5 NHS ester;CY5 NHS ESTER,Cy5-SE;Cyanine 5 monosuccinimidyl ester [equivalent to Cy5 NHS ester];2-(5-(1-(6-((2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)oxy)-6-oxohexyl)-3,3-dimethyl-5-sulfoindolin-2-ylidene)penta-1,3-dien-1-yl)-1-ethyl-3,3-dimethyl-3H-indol-1-ium-5-sulfonate;Cyanine 5, SE;2-[5-[1-[6-[(2,5-Dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1-ethyl-3,3-dimethyl-5-sulfo-3H-indolium, inner salt;(2Z)-2-[(2E,4Z)-5-[1-[6-(2,5-Dioxopyrrolidin-1-yl)oxy-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-5-sulfoindol-1-ium-2-;Sulfo-Cy5, SE
Cas No.
146368-14-1
分子式
C37H43N3O10S2
分子量
753.88
包装储存
-20 ℃,避光,24月,冰袋
详情描述

磺酸基-Cy5-乙基 琥珀酰亚胺酯(Sulfo-Cy5-E NHS Ester)是一种基于Cy5远红外荧光染料骨架改性的生物标记试剂。其分子结构在共轭的吲哚(Indole)环上引入了强吸电子的磺酸基(Sulfo-)‍,显著提升了水溶性,克服了传统Cy5在水相中的疏水性聚集问题。分子末端连接了N-羟基琥珀酰亚胺酯(NHS Ester)‍基团,使该化合物能够高效地与蛋白质、抗体或核酸分子中的伯胺基(-NH₂)发生酰胺键共价偶联。磺酸基的引入增强了分子在生理条件下的稳定性,Cy5染料在近红外区域的强荧光特性(激发/发射波长约为648/671 nm)。位于生物组织的近红外窗口(NIR),自发荧光干扰极低,光子穿透深度大,能够提供极高的信噪比和成像质量。

产品详情
Cy 系列属于花菁类染料,其中 Cy 甲基、乙基 是非水溶性形式,磺酸基-Cy 乙基是磺酸化的高水溶性形式,两者属于单反应性染料。 它们可溶于有机溶剂如 DMSO、DMF 等,被广泛用于标记肽、蛋白质和寡聚体等生物分子,特别是精细蛋白和易于变性的蛋白。Cy 系列染料除了用于标记生物分子外,也常被用于动物活体成像。由于细胞和组织的自发荧光在近红外波段小,而近红外光在生物组织中的穿透深度较大,因此在检测复杂生物系统时,Cy 系列染料能提供更高的特异性和灵敏度。同时,Cy 系列染料还拥有紫外光区染料和同位素标记无法具备的生物安全性,有利于在活生物体中监控各种标记分子的分布。
运输条件
冰袋
储存方式
-20 ℃,避光,24月,冰袋
FAQ
1.溶解后的 Cy SE 溶液最好立即使用。
2.荧光染料均存在淬灭问题,请尽量注意避光,以减缓荧光淬灭。
3.本产品仅限于科研,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
4.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
搜索质检报告(COA)

1:一般建议:溶解度为Medlife测试数据,可能与文献描述存在差异。这是由于生产工艺和批次不同产生的正常现象。为了使其更好的溶解,请用37℃加热试管并在超声波水浴中震动片刻。不同批次产品溶解度各有差异,仅做参考,具体以实验方案为准。

2:储存条件:粉末-20°C一般情况可以保存3年,溶于溶剂-80°C一般情况可以保存1年。不同产品及不同批次产品可能存在差异,请细致阅读产品信息,并辅助参考相关文献描述。

概述

磺酸基-Cy5-乙基 琥珀酰亚胺酯(Sulfo-Cy5-E NHS Ester,货号PR01393,CAS号146368-14-1)是一种基于Cy5远红外荧光染料骨架改性的生物标记试剂。其分子结构在共轭的吲哚环上引入了强吸电子的磺酸基(Sulfo-),显著提升了水溶性,克服了传统Cy5在水相中的疏水性聚集问题。分子末端连接了N-羟基琥珀酰亚胺酯(NHS Ester)基团,使该化合物能够高效地与蛋白质、抗体或核酸分子中的伯胺基(-NH₂)发生酰胺键共价偶联。磺酸基的引入增强了分子在生理条件下的稳定性,Cy5染料在近红外区域的强荧光特性(激发/发射波长约为648/671 nm),位于生物组织的近红外窗口(NIR),自发荧光干扰极低,光子穿透深度大,能够提供极高的信噪比和成像质量。

理化性质

参数 描述
外观 深蓝色至紫色固体粉末
分子式 C₃₇H₄₃N₃O₁₀S₂(基于典型结构,具体以COA为准)
分子量 约 753.9 g/mol
溶解性 易溶于水、DMSO、DMF;微溶于甲醇、乙醇
激发波长 (λex) 648 nm
发射波长 (λem) 671 nm
摩尔消光系数 ~ 250,000 L·mol⁻¹·cm⁻¹
荧光量子产率 ~ 0.2(在水相中)
储存条件 -20°C 避光干燥保存
稳定性 对光敏感,避免反复冻融;在干燥状态下稳定

应用领域

  • 蛋白质/抗体标记:用于免疫荧光(IF)、免疫组化(IHC)、流式细胞术(FACS)、Western blot 等,通过伯胺偶联实现荧光标记。
  • 核酸标记:标记氨基修饰的寡核苷酸,用于荧光原位杂交(FISH)、qPCR 探针等。
  • 活体成像:近红外荧光成像,适用于小动物活体成像,具有深组织穿透性和低背景。
  • 细胞成像:标记细胞表面蛋白或胞内蛋白,用于共聚焦显微镜、高内涵成像。
  • 多色荧光分析:与其它荧光染料(如 FITC、Cy3、Cy7)配合使用,进行多重检测。
  • 药物递送研究:标记纳米颗粒、脂质体等,追踪其体内分布。

实验方案建议

1. 标记反应的一般流程(以抗体标记为例)

  • 缓冲液准备:使用不含伯胺的缓冲液(如 PBS、碳酸氢钠缓冲液,pH 7.4-8.5)。避免使用 Tris、甘氨酸等含胺缓冲液。
  • 抗体准备:将抗体溶解于上述缓冲液中,浓度建议 1-5 mg/mL。若含有叠氮钠或 BSA,需先透析或脱盐去除。
  • 染料溶解:将 Sulfo-Cy5-E NHS Ester 用无水 DMSO 溶解成 10 mM 储备液(现配现用)。
  • 标记反应:按染料:抗体摩尔比 3:1 至 10:1 加入染料储备液,轻柔混匀,室温避光反应 1-2 小时。
  • 纯化:使用脱盐柱(如 Sephadex G-25)或超滤离心管(MWCO 30 kDa)去除游离染料。
  • 验证:测定标记后抗体的 DOL(Degree of Labeling)和荧光光谱。

2. 关键注意事项

  • pH 控制:反应 pH 应在 7.4-8.5 之间,确保伯胺去质子化。
  • 避光操作:全程避免强光照射,防止荧光淬灭。
  • 染料当量优化:过度标记可能导致抗体活性下降或荧光自淬灭,建议进行预实验优化比例。
  • 缓冲液纯度:使用高纯度水配制缓冲液,避免杂质干扰。

3. 标记效率检测

  • DOL 计算:使用紫外-可见分光光度计测量 280 nm 和 650 nm 吸光度,按公式计算。
  • 荧光光谱:确认激发/发射峰位置未发生明显偏移。

4. 常见问题与解决方案

  • 标记效率低:检查 pH 是否正确、染料是否失效、抗体浓度是否过低。
  • 聚集现象:磺酸基修饰已提高水溶性,若仍出现聚集,可适当增加 DMSO 比例或超声处理。
  • 荧光淬灭:避免使用含卤素离子的缓冲液,储存时加入少量抗氧化剂(如 0.1% 叠氮钠)。

储存条件

  • 储存温度:-20°C 避光干燥保存,有效期 12 个月。
  • 储存形式:固体粉末或无水 DMSO 储备液(分装后 -80°C 保存,避免反复冻融)。
  • 注意事项:避免暴露于强光、潮湿和高温环境;使用前平衡至室温再开盖,防止吸潮。
  • 运输条件:室温运输,避光防潮。

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产品名称 货号 特点
Sulfo-Cy3 NHS Ester PR01390 绿色荧光,激发/发射 ~550/570 nm
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Sulfo-Cy7 NHS Ester PR01396 近红外二区荧光,激发/发射 ~750/773 nm
Cy5 NHS Ester (非磺化) PR01391 有机相标记,需使用 DMF/DMSO
氨基修饰寡核苷酸 PR01002 用于核酸标记的氨基修饰引物
脱盐柱 (Sephadex G-25) PR02001 用于标记后纯化
超滤离心管 (MWCO 30 kDa) PR02005 用于蛋白标记后纯化
The molarity calculator equation
Mass (g) = Concentration (mol/L) × Volume (L) × Molecular Weight (g/mol)
The dilution calculator equation
Concentration (start) × Volume (start) = Concentration (final) × Volume (final)
This equation is commonly abbreviated as: C1V1 = C2V2