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磺酸基-Cy3-乙基 琥珀酰亚胺酯(橙红色)Sulfo-Cy3-E SE (Orange Red)

目录号: PR01389 纯度: N/A
磺酸基-Cy3-乙基 琥珀酰亚胺酯(Sulfo-Cy3-E NHS Ester)是一种基于Cyanine 3 (Cy3)染料骨架改性的亲水性荧光标记试剂,在Cy3染料的苯环上引入了磺酸基(Sulfonate Group),显著提升了水溶性,同时在染料分子末端连接了一个高活性的N-羟基琥珀酰亚胺酯(NHS酯)基团。
磺酸基-Cy3-乙基 琥珀酰亚胺酯(橙红色)(CAS 146368-16-3)产品图
CAS No. :146368-16-3
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PR01389-1mg 1mg ¥588.00 请登录
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中文名称
磺酸基-Cy3-乙基 琥珀酰亚胺酯(橙红色)
中文别名
Cy 3-N-羟基琥珀酰亚胺酯;CY3-NHS酯;磺酸基-Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯,Sulfo-Cyanine3 NHS ester;2-[3-[1-[6-[(2,5-二氧代-1-吡咯烷基)氧基]-6-氧代己基]-1,3-二氢-3,3-二甲基-5-磺基-2H-吲哚-2-亚基]-1-丙烯-1-基]-1-乙基-3,3-二甲基-5-磺基-3H-吲哚鎓内盐;CY3活化酯;磺基-CY3-N-羟基琥珀酰胺酯;CY3-SE;Cy3-N-羟基琥珀酰亚胺酯
英文名称
Sulfo-Cy3-E SE (Orange Red)
英文别名
3H-Indolium,2-[3-[1-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1-propen-1-yl]-1-ethyl-3,3-dimethyl-5-sulfo-,inner salt;3H-Indolium,2-[3-[1-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1-pro;3H-indolium-1-(5-carboxypentyl)-2-[(1E,3E)-3-(1-ethyl-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene)-1-propenyl]-3,3-dimethyl-5-sulfo-, inner salt, succinimidyl ester;Cy3 NHS Ester;Cy3-SE;Cy3-SE Cy3 NHS Ester;3H-Indolium,2-[3-[1-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-5-sulfo-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl]-1-ethyl-3,3-dimethyl-5-sulfo-,inner salt;Cy3;FluoroLink Mono Reactive Dye Cy3;CY 3-NHS;Cyanine 3;Sulfo-Cy3-SE;Cyanine3 NHS ester;Sulfo-Cyanine3 NHS ester;Cy3-NHS ester(C35H41N3O10S2);Cyanine 3 monosuccinimidyl ester [equivalent to Cy3 NHS ester];Sulfo-Cy3, SE
Cas No.
146368-16-3
分子式
C35H41N3O10S2
分子量
727.84
包装储存
-20 ℃,避光,24月,冰袋
详情描述

磺酸基-Cy3-乙基 琥珀酰亚胺酯(Sulfo-Cy3-E NHS Ester)是一种基于Cyanine 3 (Cy3)染料骨架改性的亲水性荧光标记试剂,在Cy3染料的苯环上引入了磺酸基(Sulfonate Group),显著提升了水溶性,同时在染料分子末端连接了一个高活性的N-羟基琥珀酰亚胺酯(NHS酯)基团。磺酸基的引入确保了在水相环境中的高溶解度,NHS酯基团的存在赋予了其在温和条件下(如室温、pH 7.2-8.5)快速与生物分子羧基发生酰胺键反应的能力,具有高度选择性,适用于标记蛋白质、抗体、肽段和寡核苷酸等生物分子。

产品详情
Cy 系列属于花菁类染料,其中 Cy 甲基、乙基 是非水溶性形式,磺酸基-Cy 乙基是磺酸化的高水溶性形式,两者属于单反应性染料。 它们可溶于有机溶剂如 DMSO、DMF 等,被广泛用于标记肽、蛋白质和寡聚体等生物分子,特别是精细蛋白和易于变性的蛋白。Cy 系列染料除了用于标记生物分子外,也常被用于动物活体成像。由于细胞和组织的自发荧光在近红外波段小,而近红外光在生物组织中的穿透深度较大,因此在检测复杂生物系统时,Cy 系列染料能提供更高的特异性和灵敏度。同时,Cy 系列染料还拥有紫外光区染料和同位素标记无法具备的生物安全性,有利于在活生物体中监控各种标记分子的分布。
运输条件
冰袋
储存方式
-20 ℃,避光,24月,冰袋
FAQ
1.溶解后的 Cy SE 溶液最好立即使用。
2.荧光染料均存在淬灭问题,请尽量注意避光,以减缓荧光淬灭。
3.本产品仅限于科研,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
4.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
搜索质检报告(COA)

Evaluation of bioorthogonally applicable tetrazine–Cy3 probes for fluorogenic labeling schemes

Organic & Biomolecular Chemistry 2023. DOI: 10.1039/d3ob01204b 相关性评分:55

该文献研究的是四嗪修饰的Cy3荧光探针(tetrazine–Cy3 probes),用于生物正交荧光标记。目标产品为磺酸基-Cy3-乙基琥珀酰亚胺酯(Sulfo-Cy3-NHS酯),是一种胺反应性标记试剂。文献中的Cy3探针虽同属Cy3染料骨架,但连接的是四嗪基团而非NHS酯,且未明确提及磺酸基修饰,因此并非目标化合物的直接衍生物,仅为同类染料的不同功能化形式,化合物匹配度中等偏低。应用场景为生物正交荧光标记,与产品描述的蛋白/抗体/肽段标记有一定交集,但机制不同(四嗪-烯烃环加成 vs NHS-胺偶联),相关性一般。实验模型涉及荧光标记体系,但未涉及目标产品典型的细胞成像或蛋白标记模型。方法学上提供了荧光淬灭和荧光增强性能数据,但缺乏目标化合物的光谱、标记效率、细胞毒性等关键表征。期刊为Organic & Biomolecular Chemistry,属中等影响力期刊,研究有一定创新性但引用潜力有限。总体而言,该文献与目标产品相关性中等,未真正使用目标化合物。

Cy3‐Conjugated Biocompatible Polymer Nanoparticles for Long‐Term Mitochondrial Imaging

ChemBioChem 2026. DOI: 10.1002/cbic.70323 相关性评分:52

文献使用Cy3染料共价修饰两亲性葡聚糖形成聚合物纳米颗粒,用于线粒体长期成像。但目标产品为磺酸基-Cy3-乙基琥珀酰亚胺酯(Sulfo-Cy3-NHS酯),是一种带有NHS活性酯和磺酸基的水溶性标记试剂,而文献中的Cy3很可能是未磺化的游离染料或不同衍生物,且未明确使用NHS酯偶联化学,因此仅为同类染料而非目标化合物或其直接衍生物。应用场景为细胞线粒体成像,与荧光成像相关但非产品典型的蛋白/抗体标记用途。实验使用人骨骼肌卫星细胞,与产品预期生物标记应用部分重叠。文献未提供目标化合物的光谱、标记效率或细胞毒性等关键表征数据。期刊ChemBioChem影响力中等,创新性一般。

Detecting RNA–Protein Interactions With EGFP‐Cy3 FRET by Acceptor Photobleaching

Current Protocols 2023. DOI: 10.1002/cpz1.689 相关性评分:59

文献使用Cy3标记RNA进行FRET实验,但未明确是否为磺酸基-Cy3-乙基琥珀酰亚胺酯(目标产品)。Cy3标记RNA通常通过NHS酯与氨基修饰的RNA反应,目标产品可能适用,但文献未指定染料具体形式,因此化合物匹配度较低。应用场景为RNA-蛋白相互作用检测,属于荧光标记和FRET成像,与产品用于生物分子标记的应用相关。实验模型包括固定细胞和活细胞,与产品预期细胞成像应用一致。方法学上提供了FRET方案和对照,但缺乏对Cy3染料本身的光谱、标记效率或细胞毒性等表征数据。期刊为Current Protocols,影响力中等。总体相关性中等。

Time-Resolved Fluorescence Detection of Nicked DNA via Site-Specific Stacking of Sulfo-Cy3: The Role of Charge, Polarity, Linker, and Sequence Context

The Journal of Physical Chemistry B 2025. DOI: 10.1021/acs.jpcb.5c03845 相关性评分:70

文献标题明确使用Sulfo-Cy3,且摘要(标题信息)显示研究通过位点特异性堆叠检测切口DNA,属于目标化合物的直接应用。但应用场景为DNA损伤检测/时间分辨荧光传感,与产品分类描述的蛋白质、抗体、肽段和寡核苷酸标记等通用生物分子标记场景部分契合,而非细胞成像或流式细胞术等典型应用。实验模型为DNA体系,与产品预期应用领域(生物分子标记)有一定关联但非完全一致。方法学上可能提供光谱数据和时间分辨荧光表征,但缺乏标记效率、细胞毒性等关键数据。期刊为J. Phys. Chem. B,影响力中等偏上,研究具有一定创新性。

1:一般建议:溶解度为Medlife测试数据,可能与文献描述存在差异。这是由于生产工艺和批次不同产生的正常现象。为了使其更好的溶解,请用37℃加热试管并在超声波水浴中震动片刻。不同批次产品溶解度各有差异,仅做参考,具体以实验方案为准。

2:储存条件:粉末-20°C一般情况可以保存3年,溶于溶剂-80°C一般情况可以保存1年。不同产品及不同批次产品可能存在差异,请细致阅读产品信息,并辅助参考相关文献描述。

概述

磺酸基-Cy3-乙基 琥珀酰亚胺酯(Sulfo-Cy3-E NHS Ester)是一种基于Cyanine 3(Cy3)染料骨架改性的亲水性荧光标记试剂。通过在Cy3染料的苯环上引入磺酸基(Sulfonate Group),显著提升了水溶性,同时在染料分子末端连接了一个高活性的N-羟基琥珀酰亚胺酯(NHS酯)基团。该试剂在温和条件下(如室温、pH 7.2-8.5)可快速与生物分子的伯氨基(-NH2)发生酰胺键反应,具有高度选择性,适用于标记蛋白质、抗体、肽段和寡核苷酸等生物分子。

理化性质

  • 化学名称:磺酸基-Cy3-乙基 琥珀酰亚胺酯
  • CAS号:146368-16-3
  • 货号:PR01389
  • 分子式:C<sub>35</sub>H<sub>40</sub>N<sub>3</sub>NaO<sub>10</sub>S<sub>2</sub>(基于典型结构,具体以实际产品为准)
  • 分子量:约 765.8 g/mol
  • 外观:橙红色固体粉末
  • 溶解性:易溶于水、DMF、DMSO等极性溶剂
  • 光谱性质:
  • 激发波长(Ex):约 550 nm
  • 发射波长(Em):约 570 nm
  • 摩尔消光系数:~150,000 M<sup>-1</sup>cm<sup>-1</sup>
  • 储存条件:-20°C避光干燥保存
  • 稳定性:对光敏感,需避光保存;在干燥状态下稳定,溶液状态下建议现配现用

应用领域

  • 蛋白质与抗体标记:用于免疫荧光(IF)、免疫组化(IHC)、Western Blot等检测。
  • 核酸标记:标记寡核苷酸、DNA/RNA探针,用于FISH、qPCR探针等。
  • 细胞成像:活细胞或固定细胞的荧光成像,追踪生物分子。
  • 流式细胞术:标记抗体用于多色流式分析。
  • 药物递送研究:标记纳米颗粒、脂质体等,追踪其体内分布。
  • 生物传感器构建:作为荧光探针用于检测生物分子相互作用。

实验方案建议

1. 标记反应缓冲液准备

  • 使用无氨基缓冲液(如PBS、碳酸氢钠缓冲液),pH 7.2-8.5。避免使用含伯氨基的缓冲液(如Tris、甘氨酸)。

2. 染料储备液配制

  • 将产品从-20°C取出,平衡至室温后再打开瓶盖。
  • 用无水DMSO或DMF溶解,配制成10 mM储备液(可根据需要调整)。建议现配现用,避免反复冻融。

3. 生物分子准备

  • 待标记蛋白/抗体应溶于上述缓冲液中,浓度建议≥2 mg/mL。若含有BSA、明胶等含氨基稳定剂,需先透析或脱盐去除。

4. 标记反应

  • 按染料:蛋白质摩尔比(通常5-10:1)将染料储备液缓慢加入蛋白溶液中,轻轻混匀。
  • 室温避光反应1-2小时,或4°C过夜。

5. 纯化

  • 使用凝胶过滤柱(如Sephadex G-25)或透析去除游离染料。

6. 标记效率检测

  • 测定标记产物的A<sub>550</sub>和A<sub>280</sub>,计算染料/蛋白摩尔比(DOL)。
  • 公式:DOL = (A<sub>550</sub> × ε<sub>protein</sub>) / (ε<sub>dye</sub> × A<sub>280</sub> × CF),其中CF为染料在280 nm的校正因子(Cy3的CF≈0.08)。

7. 注意事项

  • 全程避光操作。
  • 反应体系避免含有叠氮钠(可能影响标记效率)。
  • 标记后产物应避光保存于4°C,尽快使用。

储存条件

  • 短期储存:4°C避光干燥保存,可稳定数月。
  • 长期储存:-20°C避光干燥保存,建议分装避免反复冻融。
  • 溶液储存:溶解后的储备液应分装并于-20°C避光保存,避免反复冻融,建议一个月内使用。
  • 运输条件:室温运输,避光防潮。

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Q1:磺酸基-Cy3-乙基 琥珀酰亚胺酯的磺酸基团具体连接在Cy3的哪个位置?对标记反应有何影响?

磺酸基通常引入到Cy3染料的苯环上,具体位置可参考产品COA或结构式。磺酸基的引入显著提高了染料的水溶性,使其更适用于水相标记反应;同时磺酸基带负电荷,可减少染料与生物分子的非特异性结合。NHS酯基团位于分子末端,在pH 7.2-8.5条件下与伯氨基反应形成酰胺键,磺酸基不影响该反应的选择性。

Q2:用DMSO配制磺酸基-Cy3 NHS酯储备液时,浓度怎么定?配好后能反复冻融吗?

建议用无水DMSO或DMF配制储备液,具体浓度可参考说明书或根据标记反应需求调整。配好的储备液应分装成小份,于-20°C避光保存,避免反复冻融,否则可能导致NHS酯水解或染料聚集。一般建议现配现用,若需短期保存,请关注溶液状态,出现浑浊或颜色变化时停止使用。

Q3:磺酸基-Cy3 NHS酯粉末在-20°C能保存多久?开封后如何防潮?

干燥粉末在-20°C避光条件下可稳定保存较长时间,具体有效期请以产品标签或COA为准。开封前应将产品平衡至室温再开盖,避免冷凝水引入;开封后建议充氮或密封保存于干燥器内,并尽快使用。若发现粉末颜色变深或结块,可能已受潮或降解,建议停止使用并联系技术支持确认。

Q4:如何确认磺酸基-Cy3 NHS酯的纯度和活性酯含量?有HPLC或NMR数据吗?

产品质量通常通过HPLC纯度、质谱分子量确认以及NMR结构鉴定来控制,具体数据请查阅批次的COA。NHS酯活性可通过与模型胺反应或紫外-可见光谱间接评估。若您需要特定检测报告或方法细节,请联系技术支持获取对应批次的质检信息。

Q5:标记抗体时,磺酸基-Cy3 NHS酯与抗体的摩尔比多少合适?如何计算标记效率?

常用染料:抗体摩尔比范围为5-10:1,具体比例需根据抗体浓度和标记需求优化。标记后可通过测定A550和A280计算染料/蛋白摩尔比(DOL),公式中Cy3的校正因子CF约0.08。建议先进行小规模预实验,以确定适合您体系的标记条件。详细方案可参考产品说明书或联系技术支持。

Q6:用磺酸基-Cy3 NHS酯标记寡核苷酸时,缓冲液和反应时间怎么控制?

标记寡核苷酸时,建议使用无氨基缓冲液(如PBS或碳酸氢钠缓冲液),pH 7.2-8.5,避免Tris等含伯氨基成分。染料与寡核苷酸的摩尔比需根据序列长度和标记位点优化,通常可参考5-10:1范围。室温避光反应1-2小时或4°C过夜,反应后通过乙醇沉淀或凝胶过滤纯化。具体条件请结合预实验调整。

Q7:磺酸基-Cy3 NHS酯运输条件是什么?收到后需要立即冷藏吗?

该产品通常采用室温运输,避光防潮包装。收到后应尽快检查包装完整性,并按照标签建议储存于-20°C避光干燥环境。若短期使用,可于4°C避光干燥保存。避免反复冻融和暴露于潮湿环境。具体运输和储存要求请以产品说明书或COA为准。

Q8:操作磺酸基-Cy3 NHS酯粉末时需要哪些个人防护?废液如何处理?

操作时应佩戴实验服、手套和护目镜,避免吸入粉尘或接触皮肤。NHS酯类试剂可能对皮肤和呼吸道有刺激性,建议在通风橱中称量和溶解。废液应按实验室化学废液规定收集处理,不可直接排入下水道。具体安全信息请参考产品MSDS或联系安全负责人。

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The molarity calculator equation
Mass (g) = Concentration (mol/L) × Volume (L) × Molecular Weight (g/mol)
The dilution calculator equation
Concentration (start) × Volume (start) = Concentration (final) × Volume (final)
This equation is commonly abbreviated as: C1V1 = C2V2