Cy3 NHS Ester(CAS 2632339-91-2),分子式C34H40N3BF4O4,分子量641.5 g/mol。该试剂是Cy3染料的另一种常见盐类衍生物(四氟硼酸盐),在功能上与氯化物盐相同,都是通过NHS酯活性基团标记生物分子中的氨基。其物理表现为红色粉末,溶解性极佳,易溶于 DMSO、DMF 等有机溶剂,且在水相中也有一定溶解度,适用于各种生物化学反应体系。该染料同样具有高荧光量子产率和消光系数(约150,000 L·mol-1·cm-1),荧光波长与氯盐相同(Ex: 555 nm, Em: 570 nm),常用于荧光成像、蛋白质/核酸标记及药物递送系统的追踪研究。