Cy5.5-叠氮Cyanine5.5 azide

目录号: PC21421 纯度: COA
Cy5.5-叠氮(Cy 5.5 azide)是一种有效的荧光染料。Cy5.5-叠氮可以标记DNA。Cy5.5-叠氮可用于近红外活体成像。(λex=684 nm, λem=710 nm)。Cy5.5-叠氮是一种点击化学试剂。
Cy5.5-叠氮(CAS 1557136-25-0)产品图
CAS No. :1557136-25-0
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中文名称
Cy5.5-叠氮
英文名称
Cyanine5.5 azide
英文别名
1H-Benz[e]indolium, 2-[5-[3-[6-[(3-azidopropyl)amino]-6-oxohexyl]-1,3-dihydro-1,1-dimethyl-2H-benz[e]indol-2-ylidene]-1,3-pentadien-1-yl]-1,1,3-trimethyl-, chloride (1:1)
Cas No.
1557136-25-0
分子式
C43H49ClN6O
分子量
701.34
详情描述

Cy5.5-叠氮(Cy 5.5 azide)是一种有效的荧光染料。Cy5.5-叠氮可以标记DNA。Cy5.5-叠氮可用于近红外活体成像。(λex=684 nm, λem=710 nm)。Cy5.5-叠氮是一种点击化学试剂。它含有Azide基团,可以和含有Alkyne基团的分子发生铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAc)。它还可以和含有DBCO或BCN基团的分子发生环张力驱动的炔-叠氮环加成反应(SPAAC)。

性状:深蓝色固体;

溶解度:可溶于氯仿,甲醇,乙腈,DMF等有机溶剂,微溶于水;

标记对象:点击反应;

保存:避光,干燥,-20℃保存;

相关分类:Cy系列 (Cyanine);Cy5.5-叠氮

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2:储存条件:粉末-20°C一般情况可以保存3年,溶于溶剂-80°C一般情况可以保存1年。不同产品及不同批次产品可能存在差异,请细致阅读产品信息,并辅助参考相关文献描述。

概述

Cy5.5-叠氮(Cy5.5 azide,货号PC21421,CAS号1557136-25-0)是一种近红外荧光染料,含有叠氮基团,可通过点击化学反应标记含炔基或环张力炔基(如DBCO、BCN)的分子。其最大激发波长684 nm,最大发射波长710 nm,适用于DNA标记和近红外活体成像。

理化性质

  • 外观:深蓝色固体
  • 溶解性:可溶于氯仿、甲醇、乙腈、DMF等有机溶剂,微溶于水
  • 荧光特性:λ<sub>ex</sub> = 684 nm,λ<sub>em</sub> = 710 nm(近红外区)
  • 反应性:含叠氮基团,可参与铜催化的叠氮-炔环加成反应(CuAAC)和环张力驱动的炔-叠氮环加成反应(SPAAC)
  • 储存条件:避光、干燥、-20℃保存

应用领域

  • DNA标记:通过点击化学将Cy5.5荧光团标记到DNA分子上,用于检测或成像。
  • 近红外活体成像:利用其近红外荧光特性,进行小动物活体成像,具有较好的组织穿透性。
  • 点击化学标记:可与含炔基、DBCO或BCN的分子(如蛋白质、抗体、多肽、纳米颗粒等)发生CuAAC或SPAAC反应,实现荧光标记。
  • 细胞成像:标记细胞表面或内部特定分子,用于荧光显微镜观察。

实验方案建议

1. 储存液配制

  • 建议使用无水DMSO或DMF配制储备液(如1-10 mM),分装后避光保存于-20℃,避免反复冻融。

2. CuAAC反应(铜催化点击化学)

  • 反应体系:含炔基的分子(如DNA、蛋白质)与Cy5.5-叠氮(1-10当量)在PBS缓冲液(pH 7.4)中混合,加入CuSO<sub>4</sub>(终浓度0.1-1 mM)和还原剂(如抗坏血酸钠,终浓度1-5 mM),室温反应1-2小时。
  • 注意事项:铜离子可能对某些生物分子活性有影响,建议优化铜浓度和反应时间;反应后可通过透析或凝胶过滤去除游离染料。

3. SPAAC反应(无铜点击化学)

  • 反应体系:含DBCO或BCN的分子与Cy5.5-叠氮(1-5当量)在PBS或适当缓冲液中混合,室温反应2-4小时(或4℃过夜)。
  • 注意事项:反应无需铜催化剂,适合活细胞或对铜敏感的体系;反应效率受pH影响,建议pH 7.0-7.4。

4. 标记DNA示例

  • 将炔基修饰的DNA与Cy5.5-叠氮在CuAAC条件下反应,反应液经乙醇沉淀或HPLC纯化,得到荧光标记DNA。

5. 活体成像建议

  • 标记后的探针通过尾静脉注射,使用近红外成像系统(激发滤光片680 nm,发射滤光片710 nm)进行成像;注意避光操作,减少背景荧光。

6. 纯化与验证

  • 反应产物可通过透析、凝胶过滤或HPLC纯化;通过荧光分光光度计或凝胶电泳验证标记效率。

储存条件

  • 未开封产品:避光、干燥、-20℃保存,有效期见标签。
  • 储备液:用无水DMSO或DMF配制后,分装避光保存于-20℃,避免反复冻融,建议6个月内使用。
  • 操作注意:避光操作,避免接触水分和氧化剂。

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  • 其他叠氮染料:如Cy3-叠氮(PC21411)、Cy7-叠氮(PC21431)等,满足不同荧光波长需求。
Q1:用Cy5.5-叠氮做CuAAC标记DNA时,染料加多少当量?铜催化剂浓度怎么控制?

资料建议Cy5.5-叠氮可按1–10当量加入,CuSO4终浓度0.1–1 mM,抗坏血酸钠1–5 mM,室温反应1–2小时。实际当量需根据DNA量、炔基修饰效率和标记率要求优化。铜离子可能影响某些生物分子活性,建议先做小体系预实验,并通过凝胶电泳或荧光分光光度计评估标记效率。

Q2:不想用铜催化,Cy5.5-叠氮能和DBCO修饰的蛋白做无铜点击反应吗?条件怎么设?

可以。Cy5.5-叠氮可与DBCO或BCN修饰的分子发生环张力驱动的炔-叠氮环加成反应,无需铜催化剂。资料建议染料用1–5当量,在PBS等缓冲液中室温反应2–4小时或4℃过夜,pH控制在7.0–7.4。具体当量和时间需根据蛋白浓度和DBCO修饰度优化,反应后可通过透析或凝胶过滤纯化。

Q3:Cy5.5-叠氮属于叠氮化合物,实验操作和废液处理需要注意什么?

叠氮化合物应避免与酸、氧化剂和重金属离子接触,操作时佩戴手套和护目镜,在通风橱中称量和配制。废液不应直接排入下水道,应按实验室危险废物规定收集处理。产品运输条件请以包装标签和COA为准;若需安全数据表,可联系技术支持索取。

Q4:标记反应后怎么验证Cy5.5-叠氮是否成功接上DNA或蛋白?

可通过凝胶电泳观察荧光条带位移,或用荧光分光光度计检测产物在684/710 nm附近的荧光信号。对于DNA标记,乙醇沉淀或HPLC纯化后可测标记率;对于蛋白标记,透析去除游离染料后测荧光/蛋白比值。具体验证方法需结合您的分子类型,建议参考产品说明书或联系技术支持。

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The molarity calculator equation
Mass (g) = Concentration (mol/L) × Volume (L) × Molecular Weight (g/mol)
The dilution calculator equation
Concentration (start) × Volume (start) = Concentration (final) × Volume (final)
This equation is commonly abbreviated as: C1V1 = C2V2