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磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸(远红外)Sulfo-Cy5.5-E Free Acid (FIR)

目录号: PR01321
磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸(远红外),Sulfo-Cy5.5-E Free Acid (FIR),210892-23-2(innersalt)
磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸(远红外)(CAS 210892-23-2)产品图
CAS No. :210892-23-2
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中文名称
磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸(远红外)
中文别名
荧光染料;2-[5-[3-(5-羧基戊基)-1,3-二氢-1,1-二甲基-6,8-二磺基-2H-苯并[e]吲哚-2-亚基]-1,3-戊二烯基]-3-乙基-1,1-二甲基-6,8-二磺基-1H-苯并[e]吲哚鎓内盐
英文名称
Sulfo-Cy5.5-E Free Acid (FIR)
英文别名
Cy5.5;Bis Benzimide Hoechst;Zy 5.5 carboxylic acid;Cy 5.5;(2E)-2-[(2E,4E)-5-[3-(5-carboxypentyl)-1,1-dimethyl-6,8-disulfobenzo[e]indol-3-ium-2-yl]penta-2,4-di
Cas No.
210892-23-2
分子式
C41H44N2O14S4
分子量
917.05
详情描述

磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸(远红外),Sulfo-Cy5.5-E Free Acid (FIR),210892-23-2(innersalt)

搜索质检报告(COA)

The chemistry and biology of oligonucleotide conjugation

Nucleic Acid Insights 2024. DOI: 10.18609/nai.2024.018 相关性评分:22

该文献为寡核苷酸偶联化学与生物学的综述,标题和摘要(摘要为空)均未明确提及目标化合物磺酸基-Cy5.5-乙基羧酸(CAS 210892-23-2)或其直接衍生物,仅可能泛泛涉及Cy5.5类近红外荧光染料在核酸标记中的应用,因此化合物匹配度极低。应用场景(核酸/寡核苷酸标记)与Cy5.5系列染料的典型用途有一定契合,但非特异性指向该产品。无摘要与关键词,无法确认所涉细胞系、动物模型或检测体系,实验模型匹配度低。文献未提供该化合物的光谱、标记效率、细胞毒性或光稳定性等表征数据,方法学严谨性评分很低。期刊Nucleic Acid Insights影响力有限,属综述性文章,创新性与引用潜力一般。综合判断该文献与目标产品相关性弱,不能作为该化合物的直接应用或表征依据。

Structure-Based Design of a Selective Class I Histone Deacetylase (HDAC) Near-Infrared (NIR) Probe for Epigenetic Regulation Detection in Triple-Negative Breast Cancer (TNBC).

Journal of medicinal chemistry 2021. DOI: 10.1021/acs.jmedchem.0c02161 相关性评分:71

文献将Cy5.5偶联至环状缩肽抑制剂形成探针20-Cy5.5,但未明确使用目标化合物Sulfo-Cy5.5-E Free Acid或其直接衍生物,仅使用同类Cy5.5染料,故化合物匹配度较低(8分)。应用场景为近红外活体成像及表观遗传调控检测,与产品远红外成像应用高度契合(16分)。实验模型采用TNBC细胞系MDA-MB-231及异种移植瘤模型,与产品预期生物应用领域一致(18分)。文献提供了探针的亲和力、选择性及体内成像数据,但缺乏目标化合物的光谱、标记效率、细胞毒性或光稳定性等关键表征,方法学严谨性中等(12分)。发表于Journal of Medicinal Chemistry(h-index 366),研究创新性强,影响力较高(17分)。

Development of hyaluronic acid-triamcinolone acetonide transparent formulation for efficient endotoxin-induced uveitis therapy.

International journal of biological macromolecules 2026. DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2026.154375 相关性评分:52

文献使用Cy5.5标记透明质酸-曲安奈德偶联物(HATA-360)进行眼内示踪,但未明确使用目标产品磺酸基-Cy5.5-乙基羧酸,仅可能作为标记试剂或同类染料,化合物匹配度较低。应用场景为活体眼内分布成像,与Cy5.5远红外成像应用有一定相关性,但非产品典型应用(如细胞标记、流式等)。实验模型为大鼠眼内注射及视网膜上皮细胞,与产品预期生物应用领域部分一致。文献未提供Cy5.5的光谱数据、标记效率、光稳定性等关键表征,方法学严谨性不足。期刊影响力较高,但研究主题为药物制剂而非荧光探针,创新性有限。

1:一般建议:溶解度为Medlife测试数据,可能与文献描述存在差异。这是由于生产工艺和批次不同产生的正常现象。为了使其更好的溶解,请用37℃加热试管并在超声波水浴中震动片刻。不同批次产品溶解度各有差异,仅做参考,具体以实验方案为准。

2:储存条件:粉末-20°C一般情况可以保存3年,溶于溶剂-80°C一般情况可以保存1年。不同产品及不同批次产品可能存在差异,请细致阅读产品信息,并辅助参考相关文献描述。

概述

磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸(远红外)是一种水溶性的远红外荧光染料,属于花菁染料家族。其最大激发波长约为675 nm,最大发射波长约为694 nm,适用于生物标记和成像。该产品含有羧酸基团,可通过常规偶联化学与含氨基的生物分子(如蛋白质、抗体、多肽)共价结合,广泛应用于流式细胞术、免疫荧光、活体成像等领域。

理化性质

  • 化学名称:磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸(内盐)
  • CAS号:210892-23-2
  • 分子式:C<sub>37</sub>H<sub>43</sub>N<sub>2</sub>NaO<sub>8</sub>S<sub>2</sub>(基于典型结构,实际以产品为准)
  • 分子量:约 722.86 g/mol
  • 外观:深蓝色至深绿色粉末
  • 溶解性:易溶于水、DMSO、DMF等极性溶剂
  • 光谱性质:
  • 激发波长(Ex):~675 nm
  • 发射波长(Em):~694 nm
  • 消光系数:~190,000 M<sup>-1</sup>cm<sup>-1</sup>
  • 量子产率:~0.2(在水中)
  • 储存条件:-20°C避光干燥保存

应用领域

  • 生物标记:用于标记抗体、蛋白质、多肽等,进行免疫荧光染色、流式细胞分析。
  • 活体成像:远红外荧光穿透组织深度较大,适用于小动物活体成像。
  • 细胞成像:用于细胞表面或细胞内靶标的荧光成像。
  • 核酸标记:通过氨基修饰的寡核苷酸进行标记。
  • FRET分析:作为供体或受体染料用于荧光共振能量转移研究。
  • 多色分析:与其他荧光染料(如FITC、PE、Cy3等)配合进行多色流式细胞术。

实验方案建议

1. 染料储备液配制

  • 推荐使用无水DMSO或DMF配制储备液,浓度一般为1-10 mM。
  • 储备液应分装避光保存于-20°C,避免反复冻融。

2. 生物分子偶联(以抗体为例)

  • 缓冲液:使用不含氨基的缓冲液(如PBS,pH 7.4)透析或超滤去除抗体溶液中的 Tris、甘氨酸等干扰物质。
  • 反应:按染料与抗体摩尔比(通常为5-10:1)加入染料储备液,室温避光反应1-2小时。
  • 纯化:使用凝胶过滤柱(如Sephadex G-25)或超滤离心管去除游离染料。
  • 验证:测定标记后的DOL(Degree of Labeling),通过紫外-可见分光光度法计算。

3. 细胞染色

  • 对于固定细胞,可进行透化处理后与标记抗体孵育。
  • 对于活细胞表面标记,标记抗体直接与细胞孵育后洗涤即可。
  • 建议设置未标记对照和同型对照。

4. 活体成像

  • 标记的探针通过尾静脉注射,使用相应激发和发射滤光片进行成像。
  • 注意染料在体内的背景信号,建议设置未标记探针对照。

5. 注意事项

  • 避免使用含伯胺的缓冲液(如Tris),以免与染料反应。
  • 染料对光敏感,所有操作尽量避光。
  • 标记后应尽快使用,或加入稳定剂(如BSA)分装冻存。

储存条件

  • 粉末:-20°C避光干燥保存,有效期24个月。
  • 储备液:-20°C避光保存,建议分装,避免反复冻融,有效期1个月。
  • 运输条件:室温运输,避光防潮。

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  • 链霉亲和素-磺酸基-Cy5.5:用于生物素化探针的检测。
Q1:磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸(远红外)的激发和发射波长是多少?消光系数和量子产率大概多少?

该染料的激发波长约为675 nm,发射波长约为694 nm,属于远红外荧光染料。消光系数约190,000 M⁻¹cm⁻¹,量子产率约0.2(在水中)。这些光谱参数使其适用于需要深层组织穿透的成像应用。具体数值可能因仪器和溶剂环境略有差异,建议以产品COA或说明书为准。

Q2:磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸用什么溶剂配制储备液?浓度多少合适?

推荐使用无水DMSO或DMF配制储备液,浓度一般为1-10 mM。该染料易溶于水、DMSO、DMF等极性溶剂,但水溶液长期存放可能影响稳定性。配制后应分装避光保存于-20°C,避免反复冻融。具体浓度可根据偶联反应需求调整,建议参考产品说明书或联系技术支持。

Q3:磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸粉末和储备液分别怎么保存?能存多久?

粉末应在-20°C避光干燥保存,有效期24个月;储备液(DMSO或DMF配制)应分装避光保存于-20°C,有效期1个月,避免反复冻融。染料对光敏感,所有操作尽量避光。长期保存建议充惰性气体或使用避光管,并定期检查溶液外观和光谱性质。

Q4:如何确认磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸的纯度和批次一致性?

可通过产品COA获取纯度信息(如HPLC纯度)、光谱数据(吸收和发射光谱)及质谱确认。建议收到产品后核对COA与批次号,并在使用前测定吸收光谱,检查最大吸收波长和吸光度是否与说明书一致。如有疑问,可联系技术支持提供批次质检报告。

Q5:用磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸标记抗体时,染料与抗体的摩尔比和反应条件如何设置?

通常染料与抗体的摩尔比建议为5-10:1,在PBS(pH 7.4)等不含伯胺的缓冲液中室温避光反应1-2小时。反应前需去除抗体溶液中的Tris、甘氨酸等干扰物质。纯化后通过紫外-可见分光光度法测定DOL(标记度)。具体比例需根据抗体种类和实验目的优化,可参考说明书或联系技术支持。

Q6:磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸能否用于活体成像?需要注意什么?

可以,该染料远红外荧光穿透组织深度较大,适用于小动物活体成像。使用时需注意染料在体内的背景信号,建议设置未标记探针对照。标记的探针通过尾静脉注射,使用相应激发和发射滤光片成像。具体实验方案需根据模型优化,可参考文献报道或联系技术支持。

参考文献

  1. Structure-Based Design of a Selective Class I Histone Deacetylase (HDAC) Near-Infrared (NIR) Probe for Epigenetic Regulation Detection in Triple-Negative Breast Cancer (TNBC).
Q7:磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸运输条件是什么?需要冷链吗?

该产品室温运输即可,需避光防潮。收到后应按照储存条件(-20°C避光干燥)保存。运输过程中避免高温和阳光直射。若发现包装破损或产品性状异常,请及时联系供应商。具体运输要求可参考产品说明书或COA。

Q8:操作磺酸基-Cy5.5-乙基 羧酸时需要哪些个人防护?废液如何处理?

操作时应佩戴实验服、手套和护目镜,避免吸入粉尘或接触皮肤。该染料属于化学试剂,废液应按实验室化学废弃物规定处理,不得随意倾倒。具体安全信息可查阅产品MSDS(如有)或联系技术支持获取。

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The molarity calculator equation
Mass (g) = Concentration (mol/L) × Volume (L) × Molecular Weight (g/mol)
The dilution calculator equation
Concentration (start) × Volume (start) = Concentration (final) × Volume (final)
This equation is commonly abbreviated as: C1V1 = C2V2