来自于微生物的肝素(Hep)/硫酸乙酰肝素(HS)降解酶(Hepases)属于多糖裂解酶,以典型的b-消除机制裂解N-乙酰葡萄糖胺(GlcNAc)和己糖醛酸(GlcUA/IdoUA)之间的a-1,4糖苷键,并在己糖醛酸的C4和C5位生成一个在232 nm有特异吸收的不饱和双键,该双键的引入有利于酶解产物的分析检测。HEPases在Hep/HS降解菌中被鉴定,如Flavobacterium heparinum, Bacteroides thetaiotaomicron,Bacteroides stercoris,Sphingomonas, Bacillus , Pseudomonas aeruginosa[等。根据底物选择性HEPases可以分为三大类:HEPase I选择性降解Hep及HS中的高硫酸化区;HEPase III则选择性降解HS及Hep中的低硫酸化区;而HEPase II则可以同时降解Hep和HS。以上这三类HEPases都属于内切酶,最近一个肝素外切酶家族(exoHEPases)被首次发现。HEPases作为重要的工具酶,被广泛应用于Hep/HS的结构和功能研究、低分子肝素的制、肝素类药物质量检测和一致性评价等。