Cy3.5-乙基琥珀酰亚胺酯(Cy3.5-E NHS Ester)是一种基于Cyanine 3.5 (Cy3.5)骨架的胺活性荧光染料。分子核心结构为两端带有酰亚胺基(NHS)的共轭链,其特征在于骨架中间的亚苯并咪唑(Indole)与二甲氨基(Diethylamino)共轭体系,形成了强吸收与发射的电子系统。
Cy3.5-乙基琥珀酰亚胺酯为深紫色固体,极易溶于DMF、DMSO等极性有机溶剂,而不溶于水。荧光光谱特性激发波长约579 nm,发射波长约591 nm,呈现出明亮且高量子产率的红色荧光,在荧光显微镜下对比度高。