在分子克隆、DNA 测序、基因突变检测等核酸研究领域,双脱氧核苷酸(ddNTP)凭借其 “终止 DNA 链延伸” 的独特功能,成为解析核酸序列、验证基因结构的核心工具。其中,ddCTP(双脱氧胞苷三磷酸,2',3'-Dideoxycytidine 5'-Triphosphate) 作为针对胞嘧啶(C)的特异性链终止核苷酸,以高纯度、高反应活性及良好的适配性,成为科研人员开展 Sanger 测序、定点突变验证、分子标记等实验的 “精准试剂”,为从基因序列解析到突变机制研究的多场景需求提供关键支持。
三大核心科研场景,释放 ddCTP 应用价值
Sanger 测序的 “胞嘧啶终止探针”:在经典 Sanger 双脱氧链终止法测序中,ddCTP 是精准识别 DNA 序列中胞嘧啶位点的核心组分。测序反应体系中,ddCTP 与 dCTP 竞争掺入延伸的 DNA 链,当 ddCTP 掺入时,因缺乏 3'- 羟基(-OH)无法形成磷酸二酯键,DNA 链延伸随即终止 —— 通过荧光标记 ddCTP(如 FAM、TAMRA 标记),结合 capillary 电泳分离,可精准定位序列中所有胞嘧啶(C)的位置。例如,在基因克隆验证实验中,对重组质粒插入片段进行 Sanger 测序时,含 ddCTP 的测序反应可清晰识别插入序列中 C 的分布,测序准确率达 99.99%,且读长可达 500-1000bp,足以覆盖多数基因编码区,为验证克隆序列正确性、排除碱基错配提供直接依据。
基因突变检测的 “位点验证工具”:在点突变、缺失突变等基因变异分析中,ddCTP 可用于特异性验证含胞嘧啶位点的突变。例如,在肿瘤相关基因突变检测(如 EGFR 基因 19 号外显子缺失、21 号外显子 L858R 点突变)中,针对疑似突变区域设计引物,通过 “ddCTP 终止实验”(即仅添加 ddCTP 与其他 dNTP 的测序反应),可观察链终止片段的长度变化:若目标位点存在 C→T 突变,原本应插入 ddCTP 的位置将因碱基互补配对改变(G 与 C 配对变为 G 与 T 配对),导致链终止片段长度偏移,结合电泳或质谱检测可快速验证突变是否存在。此外,在 CRISPR/Cas9 基因编辑效率评估中,ddCTP 参与的测序反应可精准识别编辑位点附近的 C 碱基分布,判断编辑是否引入非预期的胞嘧啶突变,为基因编辑实验的精准质控提供支持。
分子克隆与核酸标记的 “精准调控试剂”:在体外 DNA 合成、核酸探针制备等实验中,ddCTP 可用于调控 DNA 链长度或实现特异性标记。例如,在制备特定长度的 DNA 片段(如用于电泳标准品的短链 DNA)时,通过控制 ddCTP 与 dCTP 的比例(如 1:10、1:20),可诱导 DNA 链在含 C 的位点随机终止,生成一系列不同长度的片段,经纯化后即可作为梯度标准品;在核酸原位杂交(FISH)探针制备中,将生物素或地高辛标记的 ddCTP 掺入 DNA 链,可实现对含 C 位点的特异性标记,标记效率达 90% 以上,且标记后的探针与靶序列结合特异性高(非特异性结合率<5%),为染色体定位、基因表达原位分析提供精准工具。
科研级优势,保障实验可靠性
高纯度与反应活性:纯度≥98%(HPLC 检测),不含 dCTP、ddATP/ddGTP/ddTTP 等杂质(含量<0.1%),避免非特异性链终止干扰测序或突变检测结果;经酶活验证(与 DNA 聚合酶反应效率>95%),可高效掺入 DNA 链,确保链终止反应稳定可控,批间反应效率差异<3%。
良好溶解性与稳定性:易溶于无酶纯水或常用缓冲液(如 TE 缓冲液,pH 7.5-8.0),溶解度≥10mM,可直接稀释至实验所需浓度(通常测序反应中浓度为 1-10μM);-20℃避光分装保存可稳定 24 个月,反复冻融(-20℃/ 室温)5 次仍保持 90% 以上活性,无需频繁配制,降低实验误差。
多场景适配性:兼容多种 DNA 聚合酶(如 T7 DNA 聚合酶、Sequenase™),适配 Sanger 测序、PCR-RFLP、核酸标记等实验平台;支持荧光标记、放射性标记(如 ³²P 标记)或非标记应用,可根据实验需求灵活选择,同时适配手动测序与自动化测序仪(如 ABI 3730xl),满足不同实验室的设备条件。
从基因序列的精准解析到基因突变的高效验证,再到分子克隆的精细调控,ddCTP 以 “特异性链终止 + 高可靠性” 的核心优势,成为核酸分子生物学研究中不可或缺的试剂。深入探索基因世界的奥秘,从选择专业的 ddCTP 开始!
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